Il s'agit du cours sur le schème en diminution et non en réduction ce qui est très différent. J'ai passé mal de temps à essayer de comprendre vos questions dans le mauvais sens.

1- Le silence ne fait pas partie du schème. On n'en tient donc pas compte. On peut d'ailleurs  le remplacer lors des jonctions serrées par la dernière note du schème précédent.
2- c'est vrai pour le schème initial mais pas nécessairement pour l'imitation en diminution; On place la dernière note de l'imitation au posé. Selon le nombre de notes du schème, on peut se trouver avec une imitation qui commence au posé.

3- Il faudrait me préciser de quel exemple du cours, vous parlez. Pour que cela soit clair pour tous les lecteurs, le mieux est d'envoyer une copie d'écran de l'exemple

Lorsque vous évaluez les durées des notes qui forment la pulsation, il faut intégrer les silences éventuellement présents. Ici, vous avez un 1/4 de soupir au posé, il faut en tenir un compte. Dans la première pulsation de l'imitation, vous avez 1/4 de soupir, deux doubles croches et deux triples croches soit la valeur d'une noire, la pulsation. Dans la seconde pulsation, vous avez une croche et un demi-soupir,  soit également la valeur d'une noire, la pulsation.